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글 27편
손떨림이 AI를 망친다: 포트래이가 에이블랩스와 공간전사체(Visium HD) 자동화 시스템을 만드는 이유
조직 내 세포의 위치와 유전자 발현을 동시에 분석하는 공간전사체(Spatial Transcriptomics)는 정밀 종양학의 판도를 바꾸고 있다. 그러나 화려한 AI 분석 결과의 이면에는 외면하기 힘든 현실이 있다. 고도의 정밀성을 요구하는 Visium HD 전처리 과정이 여전히 인간의 수작업에 전적으로 의존하고 있다는 점이다.
공간전사체학과 약물 영상의 융합: 정밀 약물 전달체(DDS) 평가의 새로운 패러다임
Portrai가 제안하는 정밀 DDS의 다음 단계 정밀 약물 전달체(DDS)를 설계할 때 중요한 질문은 더 이상 “약물이 종양에 가는가?”에 그치지 않습니다. 이제는 종양 안의 어디에 도달하는지, 그리고 어떤 세포가 실제로 그 약물을 받아들이는지를 함께 살펴봐야 합니다.
거리(20µm)와 경계(150µm): 공간 지표가 치료 반응을 갈라놓는 순간
다시 “같은 1기, 다른 운명”으로 돌아가며 지난 글에서 저는 TNM 병기가 훌륭한 평가 방법이지만, 종양의 설계도—즉 종양 미세환경(TME)의 생물학—까지는 말해주지 못한다는 이야기를 했습니다. 그 설계도는 종종 병기나 단일 바이오마커 한두 개로는 보이지 않습니다.
AI 시대의 '환자중심' 데이터 OS로서의 Spatial Biology
Spatial Biology의 도래 Biology를 바라보는 관점의 전환 우리가 생명현상을 탐색하고 질병을 이해하는 방식은 오랫동안 세포(cell)와 분자(molecule) 수준에서의 변화를 규명하는 데서 출발해 왔다.
대 AI 시대 Next-Generation AI in Biology & Medicine
0. Spatial Biology의 도래 우리가 생명현상을 탐색하고 질병을 이해하는 것은 오래 전부터 세포 및 분자수준에서 일어나는 변화를 탐색하기 시작하였으며 이는 구체적인 ‘신약’이란 action으로 만들어지는 long cycle을 만들어왔다.
같은 1기, 다른 운명: TNM 병기를 넘어, 공간생물학(Spatial Biology)이 말해주는 암의 진실
환자와 의사의 불안은 어디서 오는가? 임상 현장에서 암을 진료하는 의사들이 가장 두려워하는 순간은 수술이 기술적으로 실패했을 때가 아닙니다. 표준 가이드라인대로 치료했는데, 결과가 우리의 예측과 다르게 진행되어 암이 재발했을 때일 것입니다. 예를 들어, 두 명의 초기 (Stage 1) 폐암 환자, A와 B가 있다고 가정해 봅시다.
언어 모델로 세포데이터를 생성하다
Portrai VGL – Cell-as-Text에서 In Silico Spatial Biology로 신약개발의 월드 모델을 향한 Core AI 공간 생물학(spatial biology)과 단일세포 오믹스(single-cell omics)는 지금 매우 흥미로운 전환점에 와 있습니다.
Comparative analysis and integration of image-based and high-resolution sequence-based spatial transcriptomics platforms for tumor microenvironment analysis
Advances in spatial transcriptomics (ST) enable precise gene expression analysis within the tumor microenvironment (TME). VisiumHD and Xenium Prime 5K are cutting-edge platforms offering unique str...
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Target-based Understanding the Termination of the AMG 794 Clinical Trial: A Deep Dive with spatial transcriptomics data
Amgen has exited the competitive development of Claudin 6 (CLDN6) therapies, which is still in its early stages, based on initial data from preclinical studies.
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